โดยพื้นฐานแล้ว กระบวนการปฏิกิริยาของคาร์โบไฮเดรตทั้งหมดที่ฟิสเชอร์สังเคราะห์ด้วยอัลคิลไกลโคไซด์สามารถลดลงเหลือกระบวนการสองรูปแบบ คือ การสังเคราะห์โดยตรงและการทรานส์อะซิทาไลเซชัน ในทั้งสองกรณี ปฏิกิริยาอาจดำเนินไปเป็นชุดหรือต่อเนื่อง
ภายใต้การสังเคราะห์โดยตรง คาร์โบไฮเดรตจะทำปฏิกิริยาโดยตรงกับแอลกอฮอล์ไขมันเพื่อสร้างอัลคิลโพลีไกลโคไซด์สายยาวตามที่ต้องการ คาร์โบไฮเดรตที่ใช้มักจะถูกทำให้แห้งก่อนการทำปฏิกิริยาจริง (เช่น เพื่อกำจัดผลึกน้ำในกรณีของกลูโคสโมโนไฮเดรต = เดกซ์โทรส) ขั้นตอนการทำให้แห้งนี้ช่วยลดปฏิกิริยาข้างเคียงที่เกิดขึ้นเมื่อมีน้ำ
ในการสังเคราะห์โดยตรง โมโนเมอร์ชนิดของแข็งกลูโคสจะถูกใช้เป็นของแข็งอนุภาคละเอียด เนื่องจากปฏิกิริยาเป็นปฏิกิริยาของแข็ง/ของเหลวที่ไม่สม่ำเสมอ ของแข็งจะต้องถูกแขวนลอยในแอลกอฮอล์โดยสมบูรณ์
น้ำเชื่อมกลูโคสที่ย่อยสลายในระดับสูง (DE>96; DE=เดกซ์โทรสเทียบเท่า) สามารถทำปฏิกิริยาได้ในการสังเคราะห์โดยตรงที่ปรับเปลี่ยน การใช้ตัวทำละลายตัวที่สองและ/หรืออิมัลซิไฟเออร์ (เช่น อัลคิลโพลีไกลโคไซด์) ทำให้เกิดการกระจายตัวของหยดละเอียดที่เสถียรระหว่างแอลกอฮอล์และน้ำเชื่อมกลูโคส
กระบวนการทรานส์อะเซทาไลเซชันแบบสองขั้นตอนต้องใช้อุปกรณ์มากกว่าการสังเคราะห์โดยตรง ในขั้นตอนแรก คาร์โบไฮเดรตจะทำปฏิกิริยากับแอลกอฮอล์สายสั้น (เช่น เอ็น-บิวทานอล หรือโพรพิลีนไกลคอล) และอาจมีการใช้เดพลีเมนเซส (deploy-menzes) ในขั้นตอนที่สอง อัลคิลไกลโคไซด์สายสั้นจะถูกทรานส์อะเซทาไลเซชันกับแอลกอฮอล์สายยาว เพื่อสร้างอัลคิลโพลีไกลโคไซด์ตามที่ต้องการ หากอัตราส่วนโมลาร์ของคาร์โบไฮเดรตต่อแอลกอฮอล์เท่ากัน การกระจายตัวของโอลิโกเมอร์ที่ได้จากกระบวนการทรานส์อะเซทาไลเซชันจะเหมือนกับที่ได้จากการสังเคราะห์โดยตรง
หากใช้โอลิโกและโพลีไกลโคส (เช่น แป้ง น้ำเชื่อมที่มีค่า DE ต่ำ) จะต้องผ่านกระบวนการทรานส์อะเซทาไลเซชัน การดีพอลิเมอไรเซชันที่จำเป็นของวัตถุดิบตั้งต้นเหล่านี้ต้องใช้อุณหภูมิมากกว่า 140 องศาเซลเซียส ขึ้นอยู่กับปริมาณแอลกอฮอล์ที่ใช้ ซึ่งอาจทำให้เกิดความดันที่สูงขึ้นตามไปด้วย ซึ่งทำให้ต้องมีความต้องการอุปกรณ์ที่เข้มงวดยิ่งขึ้น และอาจทำให้ต้นทุนของโรงงานสูงขึ้น โดยทั่วไป ที่ความจุเท่ากัน ต้นทุนการผลิตของกระบวนการทรานส์อะเซทาไลเซชันจะสูงกว่าการสังเคราะห์โดยตรง นอกจากขั้นตอนการทำปฏิกิริยาทั้งสองขั้นตอนแล้ว ยังต้องจัดให้มีสถานที่จัดเก็บเพิ่มเติม รวมถึงสิ่งอำนวยความสะดวกสำหรับการทำงานเสริมสำหรับแอลกอฮอล์สายสั้น เนื่องจากแป้งมีสิ่งเจือปนพิเศษ (เช่น โปรตีน) อัลคิลไกลโคไซด์จึงต้องผ่านกระบวนการกลั่นเพิ่มเติมหรือละเอียดขึ้น ในกระบวนการทรานส์อะเซทาไลเซชันแบบง่าย น้ำเชื่อมที่มีปริมาณกลูโคสสูง (DE>96%) หรือกลูโคสชนิดของแข็งสามารถทำปฏิกิริยากับแอลกอฮอล์สายสั้นภายใต้ความดันปกติ ซึ่งกระบวนการนี้ได้รับการพัฒนาอย่างต่อเนื่อง (รูปที่ 3 แสดงเส้นทางการสังเคราะห์ทั้งสองเส้นทางสำหรับอัลคิลโพลีไกลโคไซด์)