โดยพื้นฐานแล้ว กระบวนการทำปฏิกิริยาของคาร์โบไฮเดรตทั้งหมดที่ฟิสเชอร์สังเคราะห์ด้วยอัลคิลไกลโคไซด์สามารถลดลงเหลือ 2 รูปแบบกระบวนการ กล่าวคือ การสังเคราะห์โดยตรงและการเปลี่ยนอะซีทาไลเซชัน ในทั้งสองกรณี ปฏิกิริยาอาจเกิดขึ้นเป็นชุดหรือต่อเนื่องกัน
ภายใต้การสังเคราะห์โดยตรง คาร์โบไฮเดรตจะทำปฏิกิริยาโดยตรงกับแฟตตี้แอลกอฮอล์เพื่อสร้างอัลคิลโพลีไกลโคไซด์สายโซ่ยาวที่ต้องการ คาร์โบไฮเดรตที่ใช้มักจะถูกทำให้แห้งก่อนเกิดปฏิกิริยาจริง (เช่น เพื่อเอาน้ำคริสตัลออก ในกรณีของกลูโคส โมโนไฮเดรต=เดกซ์โทรส) ขั้นตอนการทำให้แห้งนี้ช่วยลดปฏิกิริยาข้างเคียงที่เกิดขึ้นเมื่อมีน้ำ
ในการสังเคราะห์โดยตรง ชนิดโมโนเมอร์โซลิดกลูโคสถูกใช้เป็นของแข็งอนุภาคละเอียด เนื่องจากปฏิกิริยาเป็นปฏิกิริยาของแข็ง/ของเหลวที่ไม่สม่ำเสมอ ของแข็งจึงต้องถูกแขวนลอยในแอลกอฮอล์โดยสมบูรณ์
น้ำเชื่อมกลูโคสที่มีการสลายตัวสูง (DE>96; DE=เทียบเท่าเดกซ์โทรส) สามารถทำปฏิกิริยาในการสังเคราะห์โดยตรงแบบดัดแปลงได้ การใช้ตัวทำละลายและ/หรืออิมัลซิไฟเออร์ตัวที่สอง (เช่น อัลคิลโพลีไกลโคไซด์) ทำให้เกิดการกระจายตัวของหยดละเอียดที่เสถียรระหว่างแอลกอฮอล์และน้ำเชื่อมกลูโคส
กระบวนการทรานส์อะซีทาไลเซชันแบบสองขั้นตอนต้องใช้อุปกรณ์มากกว่าการสังเคราะห์โดยตรง ในระยะแรก คาร์โบไฮเดรตจะทำปฏิกิริยากับแอลกอฮอล์สายสั้น (เช่น เอ็น-บิวทานอลหรือโพรพิลีนไกลคอล) และเลือกใช้เมนเซสก็ได้ ในขั้นที่สอง อัลคิลไกลโคไซด์สายสั้นจะถูกทรานส์อะซีทัลไลซ์กับแอลกอฮอล์ที่มีสายยาวพอสมควรเพื่อสร้างอัลคิลโพลีไกลโคไซด์ที่ต้องการ หากอัตราส่วนโมลของคาร์โบไฮเดรตต่อแอลกอฮอล์เท่ากัน การกระจายของโอลิโกเมอร์ที่ได้รับในกระบวนการทรานส์อะซีทาไลเซชันโดยพื้นฐานแล้วจะเหมือนกับที่ได้จากการสังเคราะห์โดยตรง
หากใช้โอลิโกและโพลีไกลโคส (เช่น แป้ง น้ำเชื่อมที่มีค่า DE ต่ำ) กระบวนการทรานส์อะซีทาไลเซชันจะถูกนำไปใช้ การทำดีโพลีเมอร์ไรเซชันที่จำเป็นของวัสดุตั้งต้นเหล่านี้ต้องใช้อุณหภูมิ >140°C ขึ้นอยู่กับแอลกอฮอล์ที่ใช้ ซึ่งสามารถสร้างแรงกดดันที่สูงขึ้นตามลำดับ ซึ่งทำให้มีความต้องการอุปกรณ์ที่เข้มงวดมากขึ้น และอาจนำไปสู่ต้นทุนโรงงานที่สูงขึ้น โดยทั่วไป ที่กำลังการผลิตเดียวกัน ต้นทุนการผลิตกระบวนการ transacetalization สูงกว่าการสังเคราะห์โดยตรง นอกเหนือจากขั้นตอนปฏิกิริยาสองขั้นตอนแล้ว จะต้องจัดให้มีสถานที่จัดเก็บเพิ่มเติม เช่นเดียวกับสถานที่ทำงานเสริมสำหรับแอลกอฮอล์สายสั้น เนื่องจากมีสิ่งเจือปนเป็นพิเศษในแป้ง (เช่น โปรตีน) อัลคิลไกลโคไซด์จึงต้องผ่านการกลั่นเพิ่มเติมหรือละเอียดกว่า ในกระบวนการทรานส์อะซีทาไลเซชันแบบง่าย น้ำเชื่อมที่มีปริมาณกลูโคสสูง (DE>96%) หรือประเภทกลูโคสที่เป็นของแข็งสามารถทำปฏิกิริยากับแอลกอฮอล์สายสั้นภายใต้ความดันปกติ กระบวนการยังคงได้รับการพัฒนาบนพื้นฐานนี้ (รูปที่ 3 แสดงทั้งสองเส้นทางการสังเคราะห์อัลคิลโพลีไกลโคไซด์)